O princípio de funcionamento de um biodigestor envolve a adição de resíduos orgânicos em um tanque hermético, juntamente com água e microrganismos anaeróbios. Os microrganismos realizam a digestão anaeróbia dos resíduos, produzindo biogás e biofertilizante. O biogás pode ser utilizado como fonte de energia renovável e o biofertilizante como adubo orgânico.